ได้ละลายหินปูนมาด้วย (เนื่องจากน้ำมีความเป็นกรดอ่อน ๆ สามารถละลายหินปูนได้) เมื่อสายน้ำไหลมาพบกับบริเวณ ที่มีความลาดชัน และมีสิ่งกีดขวาง เช่น กิ่งไม้ ก้อนหิน น้ำที่ไหลมาปะทะจะเกิดการชะลอตัว และมีการตกตะกอน ของหินปูนสะสม จับอยู่ตามสิ่งกีดขวาง และพอกพูนมากขึ้นเรื่อย ๆ จนกระทั่งกลายเป็นคันกั้นน้ำและแอ่งน้ำขึ้น เมื่อเกิดเป็นระยะ ๆ ตลาดช่วงพื้นที่ลาดชัน จึงดูเสมือนกับเป็นขั้นบันไดตลอดสายน้ำที่ไหลผ่าน บางช่วงที่น้ำตกไหลตกจากที่สูงชัน หินปูนอาจก่อตัวลักษณะคล้ายหินย้อยรูปร่างแปลกตาในถ้ำ อยู่ตามบริเวณผาชันนั้น

น้ำตกหินปูนมีน้ำสีฟ้าอมเขียวใสสะอาดน่าลงเล่น เนื่องจากหินปูนหรือแคลเซียมคาร์บอเนตที่ละลายอยู่ในน้ำ รวมทั้งแร่ธาตุบางชนิดที่ปะปนอยู่ด้วย จะส่งผลให้สาหร่ายหรือตะไคร่สีเขียวขนาดเล็กที่มักเจริญเติบโตในลำธารน้ำทั่วๆ ไป ไม่สามารถแพร่ขยายพันธุ์ได้ ในแอ่งน้ำของน้ำตกหินปูนจึงไม่เป็นสีเขียว และเมื่อแสงแดดส่องลงมากระทบ น้ำจะดูดกลืนคลื่นแสงสีแดงไว้ ทำให้มองเห็นพื้นของน้ำตกหินปูนเป็นสีฟ้าอมเขียวใสแจ๋วและสวยงามที่สุด